NVIDIA CLARA PARABRICKS PIPELINES

NVIDIA Clara Parabricks ist eine hochentwickelte Suite von genomischen Analyseanwendungen, die speziell für die Verarbeitung von Hochdurchsatzdaten entwickelt wurde. Die Software bietet bahnbrechende Beschleunigungsleistungen im Vergleich zu herkömmlichen CPU-basierten Tools und ermöglicht schnelle und genaue genomische Analysen für DNA- und RNA-Anwendungen. Durch die leistungsstarke GPU-Beschleunigung von Parabricks können Forscher und Fachleute in der Genomik erstaunliche Leistungssteigerungen erzielen.

Die Software erreicht eine beeindruckende bis zu 107-fache Beschleunigung gegenüber CPU-basierten Tools, was nicht nur die Analysegeschwindigkeit dramatisch erhöht, sondern auch die Gesamtkosten erheblich senkt. Mit Parabricks kann ein ganzes menschliches Genom etwa 30-mal schneller analysiert werden, als es auf einer herkömmlichen CPU möglich wäre. Ein solcher Vorgang wird in nur etwa 16 Minuten abgeschlossen, im Vergleich zu den etwa 24 Stunden, die eine herkömmliche CPU benötigen würde. Diese drastische Beschleunigung eröffnet völlig neue Möglichkeiten für die Genomik-Forschung und die klinische Anwendung. Dank der GPU-beschleunigten Technologie kann Parabricks die Analyse von bis zu 30.000 ganzen Genomen pro Jahr auf einem einzigen Server bewältigen. Das bedeutet eine enorme Steigerung der Durchsatzleistung und ermöglicht es, große Mengen an genomischen Daten in kürzester Zeit zu verarbeiten.

Die Anwendungsbereiche von NVIDIA Clara Parabricks sind vielfältig und erstrecken sich von großen Genomsequenzierungszentren bis hin zu klinischen Versorgungseinrichtungen wie Neugeborenen-Intensivstationen und Krebszentren. Auch in Produktionsqualität- und Forschungslaboren, wo schnelle Durchlaufzeiten von entscheidender Bedeutung sind, findet Parabricks breite Anwendung.Die Suite umfasst beschleunigte Versionen von Industriestandard-Tools für den Leseabgleich, die Verarbeitung, die Qualitätskontrolle (QC) und den Variantenaufruf. Dabei werden alle relevanten Schritte in einem genomischen Analyseworkflow abgedeckt. Die nahtlose Integration in gängige Bioinformatik-Workflow-Manager ermöglicht eine hohe Skalierbarkeit, Anpassbarkeit und Verflechtung von GPU- und CPU-gesteuerten Aufgaben. Durch die Kombination beschleunigter Werkzeuge entlang des gesamten Workflows können Ergebnisse in wenigen Minuten statt in Stunden oder Tagen erzielt werden.

In der Welt der Genomik wird NVIDIA Clara Parabricks zunehmend als die bevorzugte Lösung für schnelle und präzise genomische Analysen angesehen. Die Software bietet nicht nur enorme Effizienzgewinne bei aktuellen Workflows, sondern ermöglicht auch eine benutzerdefinierte Anpassung, um den spezifischen Anforderungen und Forschungszielen gerecht zu werden. Forscher und Fachleute im Bereich der Genomik profitieren somit von einer leistungsstarken Lösung, die ihnen einen Wettbewerbsvorteil verschafft, die Forschungsarbeit beschleunigt und neue Erkenntnisse in der Genomik ermöglicht. Mit NVIDIA Clara Parabricks können sie genomische Analysen schneller, genauer und kosteneffizienter durchführen und somit einen wichtigen Beitrag zur Fortschreitung des Verständnisses von Genomforschung und personalisierter Medizin leisten.